La COFET a une architecture décentralisée. Elle est présente dans toutes les 5 régions du Togo en procédant par regroupement régional avec 6 Coordinations régionales :
- COFET- Maritime et Lomé Commune
- COFET- Plateaux –Est
- COFET Plateaux-Ouest
- COFET – Centrale
- COFET – Kara
- COFET – Savanes